TooManyCellsInteractive (TMCI) 是一個用於可視化大規模單細胞數據的工具。它提供了一個基於瀏覽器的圖形用戶界面,允許用戶以交互式的方式探索單細胞數據集,並識別特定的細胞群體。
TMCI的主要特點包括:
TMCI在性能方面也有顯著優勢。與之前的靜態實現相比,TMCI在加載、修剪和疊加特徵等操作上都有顯著的速度提升和內存使用優化。與其他常用的單細胞數據探索工具相比,TMCI在大規模數據集上的表現也更出色。
通過TMCI的案例分析,我們展示了它如何有效地識別不同癌症類型和治療時間下,藥物耐受性細胞的獨特生存通路。TMCI將有助於指導日益增大的數據可視化,並以用戶友好的方式促進多尺度數據的探索。
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by Klamann,C., ... في www.biorxiv.org 06-18-2023
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