本研究は、胃がんと腸内細菌叢の関係を明らかにすることを目的としている。96人の参加者から得られた16S-RNAシーケンスデータを分析し、胃がん患者と健常者の腸内細菌叢の違いを明らかにした。
データの前処理では、低分散の細菌属を除去し、高相関の細菌属の中から平均相関が低いものを選択した。その後、情報利得分析、LASSO回帰、線形判別分析(LDA)を用いて、胃がんと関連する17の細菌属を特定した。
LDAモデルを用いた交差検証の結果、これらの17の細菌属を用いて胃がん患者と健常者を91.67%の精度で分類できることが示された。ヒートマップとPCAバイプロットからも、これらの細菌属が胃がんの状態を良く説明できることが確認された。
今後の課題として、これらの細菌属が胃がんの発症にどのように関与しているかのメカニズムの解明が重要である。また、患者の日常習慣とこれらの細菌叢の関係を調べ、胃がんのリスク評価と予防につなげていくことが期待される。
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by Aadhith Shan... às arxiv.org 09-20-2024
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