Kernekoncepter
深度學習模型,特別是使用病理學圖像預先訓練的模型,可以有效地診斷臍帶胎兒炎症反應,有助於減少觀察者之間的差異,並可能改善新生兒敗血症的風險分層。
論文資訊
Ayada, M. A., Nateghib, R., Sharma, A., Chillrud, L., Seesillapachaia, T., Cooper, L. A. D., & Goldstein, J. A. (2023). Deep Learning for Fetal Inflammatory Response Diagnosis in the Umbilical Cord.
研究目標
本研究旨在開發並評估基於深度學習的模型,用於診斷臍帶組織切片中的胎兒炎症反應 (FIR)。
方法
研究人員收集了 4100 張經蘇木精伊紅 (H&E) 染色的臍帶組織切片,並從電子病歷中提取了相應的胎盤診斷結果。他們使用基於注意力機制的全切片學習模型構建了模型,並比較了使用非醫學圖像 (ImageNet) 預先訓練的模型 (ConvNeXtXLarge) 和使用組織病理學圖像 (UNI) 預先訓練的模型提取的特徵之間的差異。
主要發現
使用 UNI 預先訓練的模型的集成預測在測試數據集上達到了 0.836 的總體平衡準確率,而使用 ConvNeXtXLarge 預先訓練的模型的集成預測的平衡準確率較低,為 0.7209。
從準確率最高的模型生成的熱圖適當地突出了 FIR 2 病例中的動脈炎。
在 FIR 1 中,表現最佳的模型將高度關注分配給華通氏膠中呈現活化狀態的基質區域。然而,其他表現良好的模型則將注意力分配給臍血管。
主要結論
使用組織病理學圖像預先訓練的深度學習模型可以有效地診斷臍帶組織切片中的 FIR,有助於減少病理學家之間的觀察者差異。
未來的工作可能會檢驗這些模型在識別患有全身炎症反應或早發性新生兒敗血症風險的嬰兒方面的效用。
研究意義
這項研究表明,深度學習模型,特別是使用病理學圖像預先訓練的模型,可以成為診斷 FIR 的有價值的工具。這對於改善新生兒的預後具有潛在意義,因為 FIR 與不良的圍產期結果相關。
局限性和未來研究方向
未來需要在更大的、更多樣化的數據集上驗證這些模型,以評估其在不同人群中的泛化能力。
未來可以探索將這些模型整合到臨床工作流程中的方法,以協助病理學家進行診斷。
Statistik
研究人員收集了 4100 張經蘇木精伊紅 (H&E) 染色的臍帶組織切片。
數據集包括 3337 個無炎症的臍帶 (FIR 0)、480 個 FIR 1、252 個 FIR 2 和 31 個 FIR 3。
使用 UNI 預先訓練的模型的集成預測在測試數據集上達到了 0.836 的總體平衡準確率。
使用 ConvNeXtXLarge 預先訓練的模型的集成預測的平衡準確率較低,為 0.7209。