이 연구는 아마존 유래 Theobroma grandiflorum(cupuassu)의 고품질 염색체 수준 유전체를 해독하고 분석하였다. 주요 결과는 다음과 같다:
T. grandiflorum 유전체는 423 Mb 크기로 10개의 염색체로 구성되어 있으며, T. cacao 유전체와 65% 유전자 공통성을 보인다. 이는 두 종이 유사한 진화 역사를 공유하고 있음을 시사한다.
T. grandiflorum 유전체에서는 LTR 레트로트랜스포존의 폭발적 증가가 관찰되었으며, 이는 종 분화 이후 유전체 구조 변화의 주요 요인으로 작용했다.
과일 및 종자 특성, 병 저항성 등과 관련된 유전자들이 양성 선택압을 받고 있는 것으로 나타났다. 이는 유전자 중복 이후 기능 분화와 신기능화 과정을 거쳐 적응 진화가 일어났음을 시사한다.
T. grandiflorum 고유의 유전자 군집과 유전자 가족 확장/축소 패턴이 확인되었다. 이는 과일 품질, 향미, 저항성 등 주요 농업형질의 차별화에 기여했을 것으로 보인다.
종합적으로 이 연구는 T. grandiflorum 유전체 정보를 제공하여 육종 및 보존 노력을 지원하고, 아마존 생물경제 발전에 기여할 것으로 기대된다. 또한 식물 적응 진화와 다양성 창출 메커니즘에 대한 통찰을 제공한다.
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by Alves,R. M.,... alle www.biorxiv.org 12-23-2023
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.12.23.573069v1Domande più approfondite