핵심 개념
金色鳥翼蝶Troides aeacusの高品質な染色体レベルゲノムアセンブリを報告し、この重要な蝶類の生物学的理解と保全に役立つ新しい資源を提供する。
초록
本研究は、アジア地域に広く分布する金色鳥翼蝶Troides aeacusの初めての染色体レベルゲノムアセンブリを報告している。
主な内容は以下の通り:
PacBio SMRT及びOmni-C技術を組み合わせて、351 Mbのゲノムアセンブリを作成した。アセンブリの98.94%が30の擬似染色体にアンカーされており、N50値は12.2 Mbと高い連続性を示した。
28,749の蛋白質コード遺伝子を予測し、BUSCO解析でも98.9%の完全性が確認された。これは、この重要な蝶類の生物学的理解と保全に役立つ高品質なゲノムリソースを提供するものである。
反復配列の解析では、LINE、SINE、DNA転移因子などが主要な構成要素であることが明らかになった。
本ゲノムアセンブリは、鳥翼蝶の系統進化や多様性、さらには保全対策の基盤となる重要な資源である。
통계
本研究では、27 Gbのハイフィデリティリードを生成し、平均リード長は9,688 bpであった。
また、21.7 GbのOmni-Cデータを統合して、最終的な350.66 Mbのゲノムアセンブリを得た。