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3D-TransUNet for Brain Metastases Segmentation in BraTS2023 Challenge Report


Conceitos essenciais
TransUNet model combines Transformer self-attention with U-Net for brain metastases segmentation.
Resumo

Abstract:

  • Brain tumors, especially metastases, pose challenges due to diverse appearances and sizes.
  • TransUNet model combines Transformer self-attention with U-Net for segmentation precision.

Method:

  • 3D-TransUNet variants: Encoder-only and Decoder-only explored.
  • Encoder-only requires Masked-Autoencoder pre-training for better initialization.

Training Details:

  • MAE Pre-training accelerates convergence, improving performance.

Experiments and Results:

  • Encoder-only model secures second place in BraTS-METS 2023 challenge.

Conclusion:

  • TransUNet model shows promise for brain metastases segmentation.
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Estatísticas
Masked-Autoencoder pre-training is required for a better initialization of the Transformer Encoder and accelerates the training process. The average lesion-wise Dice score on the test set was 59.8%. The Decoder-only model demonstrates a substantial increase in Dice score by 2.9%.
Citações

Principais Insights Extraídos De

by Siwei Yang,X... às arxiv.org 03-26-2024

https://arxiv.org/pdf/2403.15735.pdf
3D-TransUNet for Brain Metastases Segmentation in the BraTS2023  Challenge

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