探討多模態動態：多模態融合於生物醫學任務中的洞察與挑戰

Centrala begrepp

雖然多模態動態融合在生物醫學分類任務中展現潛力，但模態資訊量的預測仍存在挑戰，而特徵資訊量則為提升模型效能和可解釋性提供了可行的方向。

Sammanfattning

多模態動態融合於生物醫學任務中的洞察與挑戰

這篇研究論文深入探討了 Han 等人 (2022) 提出的多模態動態 (MM dynamics) 方法，該方法旨在將多模態融合應用於生物醫學分類任務。MM dynamics 演算法整合了特徵層級和模態層級的資訊量，以動態融合多種模態數據，從而提升分類效能。

本研究旨在驗證 MM dynamics 方法在新的生物醫學數據集上的有效性，並探討其在圖像數據上的擴展性。

複製 MM dynamics
研究人員首先嘗試在新的數據集上複製 MM dynamics 的結果。他們使用了包含單細胞基因表達譜 (RNA)、蛋白質水平 (蛋白質) 和組織病理學圖像的數據集。
圖像 MM dynamics
為了將 MM dynamics 擴展到圖像數據，研究人員對演算法的兩個關鍵組件進行了調整：

特徵資訊量計算： 由於圖像數據中資訊量並非來自單個像素，而是來自相鄰像素群，因此研究人員採用了 U-net 架構來計算圖像塊的顯著性。
單模態編碼器： 研究人員使用了一個包含卷積層、最大池化層和全連接層的 CNN 架構來處理圖像數據。

Viktiga insikter från

Exploring Multi-Modality Dynamics: Insights and Challenges in Multimodal Fusion for Biomedical Tasks

by Laura Wender... på arxiv.org 11-04-2024

https://arxiv.org/pdf/2411.00725.pdf

Djupare frågor

如何更有效地預測模態資訊量，以提升多模態動態融合的效能？

要更有效地預測模態資訊量 ([TCP])，可以考慮以下幾種方法：

改進 [TCP] 預測模型：

使用更深層的迴歸網路： 目前的 [TCP] 預測模型只有一個隱藏層，可以嘗試使用更深層的網路，例如多層感知器 (MLP) 或卷積神經網路 (CNN)，以提升模型的表達能力。
探索更先進的預測方法： 除了迴歸網路，還可以探索其他預測方法，例如支持向量機 (SVM) 或隨機森林 (RF)，以及考慮使用集成學習方法來組合多個預測模型的結果。
引入注意力機制： 注意力機制可以幫助模型更準確地捕捉不同模態之間的關係，從而提升 [TCP] 的預測準確度。

優化損失函數：

使用更適合的損失函數： 目前使用的是 L2 損失函數，可以嘗試使用其他損失函數，例如交叉熵損失函數或 KL 散度損失函數，以更好地評估 [TCP] 預測的準確度。
動態調整損失權重： 可以根據不同模態的預測難度或重要性，動態調整損失函數的權重，以提升整體預測的準確度。

結合其他模態資訊：

利用模態間的相關性： 可以利用不同模態之間的相關性來提升 [TCP] 的預測準確度。例如，可以使用一個模態的預測結果來輔助另一個模態的 [TCP] 預測。
引入外部知識： 可以引入外部知識，例如醫學文獻或專家經驗，來輔助 [TCP] 的預測。

改進數據預處理和特徵工程：

處理缺失數據： 對於缺失的模態數據，可以嘗試使用插值法或其他方法進行填充，以避免影響 [TCP] 的預測。
進行特徵選擇和降維： 可以通過特徵選擇和降維方法來減少數據的維度，從而提升 [TCP] 預測模型的效率和準確度。

通過以上方法的改進，可以更有效地預測模態資訊量，從而提升多模態動態融合的效能，使其在生物醫學領域的應用更加廣泛和可靠。

MM dynamics 方法是否適用於其他類型的生物醫學數據，例如時間序列數據？

MM dynamics 方法原則上可以應用於其他類型的生物醫學數據，例如時間序列數據，但需要進行一些調整和適配。
1. 特徵資訊量計算：

時間序列特徵： 需要根據時間序列數據的特點設計合適的特徵資訊量計算方法。例如，可以使用卷積神經網路 (CNN) 或循環神經網路 (RNN) 來提取時間序列數據中的特徵，並根據特徵的重要性來計算特徵資訊量。
時間注意力機制： 可以引入時間注意力機制，讓模型學習不同時間點的特徵重要性，從而更準確地捕捉時間序列數據中的動態變化。
2. 模態資訊量計算：

時間序列分類器： 需要使用適合時間序列數據的分類器來計算模態資訊量，例如 RNN、長短期記憶網路 (LSTM) 或門控循環單元 (GRU)。
時間一致性： 可以考慮時間序列數據的時間一致性，例如使用滑動窗口方法來計算一段時間內的模態資訊量，而不是僅僅考慮單個時間點。
3. 模型架構調整：

多模態時間序列融合： 需要設計合適的模型架構來融合不同模態的時間序列數據。例如，可以使用多模態 RNN 或多模態 Transformer 來實現。
動態時間融合： 可以根據時間序列數據的動態變化，動態調整不同模態的融合權重，以提升模型的預測準確度。
4. 應用場景：

疾病診斷： 可以利用多模態時間序列數據，例如 ECG、EEG 和患者生命體徵數據，來進行疾病診斷。
治療效果預測： 可以利用多模態時間序列數據來預測患者對不同治療方案的反應，從而制定個性化的治療方案。
總之，MM dynamics 方法可以應用於時間序列數據和其他類型的生物醫學數據，但需要根據數據的特點進行適當的調整和優化。

如何將特徵資訊量和模態資訊量更有效地整合到多模態融合模型中？

更有效地整合特徵資訊量和模態資訊量到多模態融合模型中，可以提升模型的效能和可解釋性。以下是一些方法：
1. 動態加權融合：

基於資訊量的動態加權： 根據特徵資訊量和模態資訊量動態調整不同特徵和模態的融合權重。資訊量高的特徵和模態應該獲得更高的權重，反之亦然。
門控機制： 可以使用門控機制，例如 LSTM 中的遺忘門和輸入門，來選擇性地融合不同特徵和模態的資訊。
2. 多階段融合：

先特徵後模態： 可以先在特徵層面進行融合，利用特徵資訊量選擇重要的特徵，然後再進行模態層面的融合，利用模態資訊量選擇重要的模態。
迭代融合： 可以採用迭代的方式，逐步融合不同特徵和模態的資訊，並在每次迭代中更新特徵資訊量和模態資訊量。
3. 基於圖神經網路的融合：

構建多模態圖： 可以將不同特徵和模態表示為圖中的節點，並根據特徵資訊量和模態資訊量構建節點之間的邊，從而構建一個多模態圖。
圖神經網路融合： 可以使用圖神經網路 (GNN) 來學習多模態圖中的節點表示，從而實現多模態融合。
4. 可解釋性增強：

資訊量可視化： 可以將特徵資訊量和模態資訊量可視化，例如使用熱力圖或柱狀圖，以幫助理解模型的決策過程。
注意力機制解釋： 如果使用了注意力機制，可以分析注意力權重，以理解模型在融合過程中關注哪些特徵和模態。
5. 其他方法：

聯合學習： 可以將特徵資訊量和模態資訊量的學習整合到多模態融合模型的訓練過程中，通過聯合優化來提升模型的整體效能。
強化學習： 可以使用強化學習方法來學習最佳的特徵和模態融合策略，從而最大化模型的預測準確度。
總之，將特徵資訊量和模態資訊量更有效地整合到多模態融合模型中，需要根據具體的應用場景和數據特點選擇合適的方法。通過不斷探索和創新，可以開發出更加高效、準確和可解釋的多模態融合模型，為生物醫學研究和臨床應用提供更有力的支持。