Centrala begrepp
乳がん細胞の進化過程において、まれな有利な「運転手」変異と頻繁な有害な「乗客」変異の相互作用を記述するタグ・オブ・ウォー・モデルを、モラン・モデルと分岐過程の2つのフレームワークで検討した。両モデルで得られる変異頻度スペクトルの特徴が良く一致することを示し、3つの乳がん検体のデータに当てはめることで、「乗客」変異が腫瘍形成過程で有害な選択圧を及ぼしていることを支持する結果を得た。
Sammanfattning
本研究では、乳がん細胞の進化過程において、まれな有利な「運転手」変異と頻繁な有害な「乗客」変異の相互作用を記述するタグ・オブ・ウォー・モデルを、モラン・モデルと分岐過程の2つのフレームワークで検討した。
まず、両モデルの長期的な振る舞いを、選択圧の強さの異なる3つのシナリオで比較した。その結果、変異頻度スペクトルなどの統計量が、モラン・モデルAと条件付き分岐過程で良く一致することが分かった。一方、モラン・モデルBでは、集団の適応度が時間とともに増加する傾向が見られた。
次に、3つの乳がん検体のデータにタグ・オブ・ウォー・モデルを当てはめて、選択係数を推定した。その結果、全ての検体で「乗客」変異の選択係数が0でない値を示し、「乗客」変異が腫瘍形成過程で有害な選択圧を及ぼしていることが支持された。
以上より、モラン・モデルAと条件付き分岐過程は、タグ・オブ・ウォー・モデルの振る舞いを良く捉えられることが示された。また、乳がん細胞の進化過程では、まれな「運転手」変異と頻繁な「乗客」変異の相互作用が重要な役割を果たしていることが明らかになった。
Statistik
乳がん検体G2の変異の種類別統計量は、C:G>T:Aが圧倒的に多い。
乳がん検体G32の「運転手」変異の選択係数sは小さい値を示す。
乳がん検体G41の「運転手」変異の選択係数sは比較的大きい値を示す。
Citat
「運転手」変異は腫瘍形成に寄与するが、「乗客」変異の大部分は中立的または若干有害である。
「運転手」変異と「乗客」変異の相互作用を記述するモデルは、がんの進化を理解する上で重要である。