不考慮火星水冰雲層的垂直結構會導致在極地區域嚴重低估雲層光學深度(最多可達25%至50%),而在赤道區域則會略微高估。此外,考慮雲層內部冰粒子尺寸的垂直梯度也會對反演結果產生一定影響,但相對於雲層高度的影響較小。