核心概念
研究發現一種名為「Hardy」的幽門螺桿菌生態種,與常見的「Ubiquitous」幽門螺桿菌有著共同祖先,但基因組中存在顯著差異,這些差異可能影響其毒性和宿主互動。
摘要
幽門螺桿菌生態種:Hardy 與 Ubiquitous
本文探討了一種新發現的幽門螺桿菌生態種「Hardy」,並分析其與常見生態種「Ubiquitous」的關係。
Hardy 生態種的特徵
- 與 Ubiquitous 生態種共享大部分基因組,但在約 100 個基因中存在單核苷酸多態性差異,這些基因主要編碼外膜蛋白和宿主交互作用因子。
- 大多數 Hardy 菌株具有第二種脲酶,其輔因子為鐵而非鎳。
- 擁有兩個額外的空泡毒素 VacA 基因拷貝。
- 分佈範圍有限,主要存在於西伯利亞和美洲的原住民以及從人類傳播到其他哺乳動物的譜系中。
Hardy 與 Ubiquitous 的共同演化
- 多態性數據分析表明,Hardy 和 Ubiquitous 在現代人類離開非洲之前就已共存於人類胃中。
- 兩種生態種都隨著人類遷徙而散佈到世界各地。
研究意義
- 本研究揭示了即使在菌株之間存在持續的基因交換,細菌種群內仍可出現並穩定維持高度不同的適應策略。
- Hardy 生態種的發現為幽門螺桿菌的進化和致病機制提供了新的見解。
統計資料
Hardy 生態種在約 100 個基因中與 Ubiquitous 生態種存在單核苷酸多態性差異。
引述
“Here we identify a ‘Hardy’ ecospecies of H. pylori that shares the ancestry of ‘Ubiquitous’ H. pylori from the same region in most of the genome but has nearly fixed single-nucleotide polymorphism differences in 100 genes, many of which encode outer membrane proteins and host interaction factors.”
“Analysis of polymorphism data implies that Hardy and Ubiquitous coexisted in the stomachs of modern humans since before we left Africa and that both were dispersed around the world by our migrations.”