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洞見 - 計算生物學 - # 細胞訊息傳遞與胚胎發育

海鞘胚胎中神經誘導過程中資訊傳輸的優化限制了細胞表面接觸面積


核心概念
海鞘胚胎中,細胞表面與 FGF 信號分子的接觸面積影響 ERK 訊息傳遞效率,進而調控神經細胞分化,此現象顯示細胞幾何形狀在胚胎發育中扮演著關鍵角色。
摘要

海鞘胚胎神經誘導研究

本研究以海鞘胚胎為模型,探討細胞表面接觸面積與細胞訊息傳遞效率之間的關係,及其對神經細胞分化的影響。

研究背景

海鞘胚胎發育過程具高度不變性,細胞分裂的位置和時間在個體間幾乎一致。在 32 細胞時期,主要的組織特異性細胞譜系(肌肉、內胚層、神經系統等)幾乎完成分化。海鞘胚胎發育過程中沒有細胞生長或遷移,且相關發育資訊豐富,使其成為研究細胞命運決定和體軸建立的理想模型。

研究方法

研究人員建立了一個隨機模型,模擬 FGF 訊息傳遞路徑中 ERK 激活的過程。模型考慮了細胞表面與 FGF 和 ephrin(一種抑制 ERK 激活的分子)接觸的面積,並假設細胞表面受體密度均勻分佈。

研究結果
  1. 單一細胞模型顯示,細胞表面與 FGF 接觸面積存在一個最佳值,可最大化 FGF 濃度與 ERK 激活之間的訊息傳遞效率。
  2. 多細胞模型顯示,在 FGF 總接觸面積受限的情況下,細胞會打破對稱性,調整與 FGF 接觸的面積,以優化訊息傳遞效率。
  3. 實驗觀察到的海鞘胚胎中細胞表面接觸面積與模型預測的最佳值高度吻合,顯示細胞幾何形狀在神經誘導過程中扮演著關鍵角色。
研究結論

海鞘胚胎利用細胞表面接觸面積作為調控機制,精確控制 ERK 訊息傳遞效率,進而影響細胞命運決定和神經細胞分化。此研究結果揭示了細胞幾何形狀在胚胎發育中的重要性。

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統計資料
海鞘胚胎在 32 細胞時期進行神經誘導。 a6.5 細胞的平均表面積為 6837 ± 248 µm²。 a6.6 細胞的平均表面積為 8268 ± 172 µm²。 a6.7 細胞的平均表面積為 7331 ± 310 µm²。 a6.8 細胞的平均表面積為 8646 ± 135 µm²。 FGF 基線濃度約為 0.1 nM。 FGF 受體的解離常數 (Kd) 為 6 nM。 模型預測的訊息傳遞量約為 2.4 ± 0.1 位元。
引述

深入探究

細胞表面接觸面積的調控機制是什麼?

細胞表面接觸面積的調控是一個複雜的過程,受到多種因素的影響,例如: 細胞骨架的調節: 細胞骨架,特別是肌動蛋白絲,在細胞形態和接觸面積的調節中起著至關重要的作用。細胞可以通过聚合或解聚肌动蛋白丝来改变其形状和与其他细胞的接触面积。 細胞黏附分子的調控: 細胞表面的黏附分子,例如鈣黏蛋白,介導細胞與細胞以及細胞與細胞外基質之間的黏附。細胞可以通过调节黏附分子的表达水平、活性或分布来改变其接触面积。 細胞外基質的影響: 細胞外基質的組成和結構可以影響細胞的形態和接觸面積。例如,基底膜可以為細胞提供支撐並限制其擴散。 機械力的影響: 細胞可以感知和響應機械力,例如拉伸或壓縮。這些機械力可以通過影響細胞骨架和黏附分子來調節細胞接觸面積。 在海鞘胚胎神經誘導的例子中,細胞表面接觸面積的調控很可能是由上述多種因素共同作用的結果。胚胎發育過程中,細胞分裂模式、細胞間的相互作用以及細胞外基質的變化都可能影響細胞的接觸面積,進而影響 ERK 訊息傳遞路徑的活性,最終決定細胞的命運。

除了 ERK 訊息傳遞路徑,細胞表面接觸面積是否影響其他訊息傳遞路徑?

是的,細胞表面接觸面積不僅影響 ERK 訊息傳遞路徑,也影響其他許多訊息傳遞路徑,例如: Notch 訊息傳遞路徑: Notch 訊息傳遞路徑是一種重要的細胞間通訊途徑,它依賴於細胞表面受體 Notch 與相鄰細胞表面配體(如 Delta 或 Jagged)的直接接觸。細胞接觸面積的變化會影響 Notch 受體與配體的結合,進而影響訊息傳遞的強度。 Wnt 訊息傳遞路徑: Wnt 訊息傳遞路徑在細胞增殖、分化和形態發生中起著關鍵作用。Wnt 配體需要與細胞表面的 Frizzled 受體和 LRP 共受體結合才能激活下游訊息傳遞。細胞接觸面積的變化會影響 Wnt 配體與受體的結合效率,進而影響訊息傳遞的強度。 Hippo 訊息傳遞路徑: Hippo 訊息傳遞路徑是一種調節細胞生長和器官大小的關鍵途徑。細胞接觸面積的變化會影響 Hippo 途徑的核心組成部分(如 YAP/TAZ)的活性,進而影響細胞的增殖和器官的大小。 總之,細胞表面接觸面積是一種重要的調節機制,它可以通過影響細胞表面受體與配體的結合來調節多種訊息傳遞路徑的活性,進而影響細胞的行為和命運。

細胞如何感知和調整其表面接觸面積以優化訊息傳遞效率?

細胞感知和調整其表面接觸面積以優化訊息傳遞效率是一個複雜且尚未完全理解的過程。目前的研究表明,細胞可能利用以下機制來實現這一目標: 機械力感知: 細胞可以通过細胞骨架和黏附分子感知細胞外基質的硬度、細胞間的擠壓以及其他機械力。這些機械力可以觸發細胞內部的訊息傳遞,進而調節細胞骨架的重排、黏附分子的表達和細胞接觸面積的調整。 細胞表面受體的動態調節: 細胞可以通過內吞作用、胞吐作用和側向擴散等方式動態調節細胞表面受體的數量和分布。例如,當細胞接觸面積較小時,細胞可以增加細胞表面受體的密度,以提高訊息傳遞的效率。 細胞間通訊: 細胞可以通过分泌可溶性因子或直接接觸相鄰細胞來進行通訊。這些通訊方式可以幫助細胞協調其行為,包括調整細胞接觸面積以優化訊息傳遞效率。 在海鞘胚胎神經誘導的例子中,細胞可能通過感知 FGF 和 ephrin 的濃度梯度,以及與相鄰細胞的接觸面積,來調整其自身的接觸面積,以優化 ERK 訊息傳遞路徑的活性,最終決定細胞的命運。 需要進一步的研究來 fully elucidate 細胞感知和調整其表面接觸面積以優化訊息傳遞效率的具體機制。
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