本文介紹了兩個代理基於模型,描述細胞動力學的例子:雙相胞外基質細胞模型(BVCBM)和隨機細胞侵襲模型。對於這兩個模型,我們使用合成數據(從模型生成)和真實世界觀測數據來推斷模型參數及其不確定性,採用統計和神經模擬推論算法。
對於合成數據,我們使用標準的統計和神經模擬推論算法。但是,當使用真實世界觀測數據時,由於可能存在模型錯配,我們應用強健版本的模擬推論算法。
我們說明了如何評估和驗證每種模擬推論算法的推論結果,並比較它們的性能。我們的結果不僅揭示了不同模擬推論方法在真實世界情景中的有效性,還為增強神經模擬推論方法提供了潛在的途徑。
本文為計算生物學家和數學生物學界提供了全面的指南,介紹如何使用真實世界觀測數據推斷模型參數及其不確定性。
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