自然受精時のオビダクトの反応を多オミクス解析とマシンラーニング予測で明らかにする

核心概念

オビダクトは、精子や胚の存在に応じて時空間的に遺伝子発現とタンパク質産生を動的に変化させる適応的な器官である。

摘要

本研究では、マウスのオビダクトにおける自然受精時の遺伝子発現とタンパク質発現の変化を、マルチオミクス解析によって明らかにした。

主な知見は以下の通り:

• 0.5日目は、オビダクトの近位部(子宮卵管接合部)で炎症応答関連遺伝子が誘導される。これは精子の存在によるものと考えられる。
• 1.5日目以降は、近位部で解糖系関連遺伝子が発現上昇し、発生中の胚に代謝的支援を提供していると示唆される。
• 単一細胞RNA-sequencingの結果、分泌上皮細胞が炎症応答の主要な調節細胞であることが明らかになった。
• オビダクト内腔液のプロテオーム解析では、自然受精と過剰排卵処理で異なるタンパク質発現パターンが観察された。
• 転写データとプロテオーム データを統合したAIモデルにより、オビダクトの適応応答に関与する転写因子を同定できた。

以上より、オビダクトは精子や胚の存在に応じて時空間的に遺伝子発現とタンパク質産生を動的に変化させる適応的な器官であることが明らかになった。

统计

0.5日目のオビダクト近位部では、炎症応答関連遺伝子(Tlr2、Ly6g、Ptprc)の発現が上昇していた。
1.5日目のオビダクト近位部では、解糖系関連遺伝子(Dusp5、Mapk14)の発現が上昇していた。
0.5日目のオビダクト内腔液では、炎症関連タンパク質の発現が高かった。

引用

"オビダクトは、精子や胚の存在に応じて時空間的に遺伝子発現とタンパク質産生を動的に変化させる適応的な器官である。"
"分泌上皮細胞が炎症応答の主要な調節細胞であることが明らかになった。"
"オビダクトの適応応答に関与する転写因子をAIモデルによって同定できた。"

从中提取的关键见解

Multi-omics analyses and machine learning prediction of oviductal responses in the presence of gametes and embryos

by Finnerty,R. ... 在 www.biorxiv.org 06-15-2024

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.13.598905v1

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