GAT1 輸送体における Na+ イオンの相互作用：効率的な取り込みから基質および構造の安定化まで

核心概念

GAT1 輸送体は、GABA の再取り込みを Na+ および Cl- イオンの共輸送によって行う。Na+ イオンの結合は、GAT1 の構造と機能を安定化させ、GABA 取り込みを促進する。

摘要

本研究では、分子動力学シミュレーションを用いて、GAT1 輸送体における Na+ イオンの結合と機能を明らかにした。

主な知見は以下の通り:

1. GAT1 の細胞外ベシクルの入り口に位置する負電荷アミノ酸残基(D281、E283)が、Na+ イオンを引き付ける「Na+ 取り込みサイト」を形成し、Na+ の結合を促進する。この取り込みサイトの変異により、Na+ 結合速度が低下し、Na+ 依存性GABA 取り込みが減少した。

2. Na1 サイトに結合したNa+ イオンは、GABA の結合を安定化する。一方、Na2 サイトに結合したNa+ イオンは、GAT1 の外向き開放型構造を安定化し、内側ゲートの閉鎖を促進する。

3. Na2 サイトへのNa+ 結合は、GAT1 の bundle ドメインと scaffold ドメインの相対的な運動を抑制し、TM5aの安定化を介して内側ゲートを閉鎖する。

4. GABA の結合は、Na1 サイトへのNa+ の結合を強化し、Na1 サイトの構造変化を誘導する。これにより、GABA とNa+ の協調的な結合が促進される。

以上より、Na+ イオンの効率的な取り込みと、Na1 および Na2 サイトへの結合が、GAT1 の構造と機能の安定化に重要な役割を果たすことが明らかになった。

统计

GAT1 の D281A-E283A 変異体では、Na+ 依存性GABA 取り込みのEC50が野生型の1.7倍に増加した。
GAT1 の D281A-E283A 変異体では、GABA 取り込みのVmaxが野生型の4分の1に減少した。
GAT1 の D281A-E283A 変異体では、GABA 取り込みのKmが野生型の約半分に減少した。

引用

「Na+ 取り込みサイトは、Na+ イオンを引き付けることで局所的なNa+ 濃度を高め、Na+ 親和性を間接的に高める役割を果たす」
「Na2 サイトへのNa+ 結合は、GAT1 の bundle ドメインと scaffold ドメインの相対的な運動を抑制し、内側ゲートの安定化に寄与する」
「GABA の結合は、Na1 サイトへのNa+ の結合を強化し、Na1 サイトの構造変化を誘導する」

从中提取的关键见解

Interaction of GAT1 with sodium ions: from efficient recruitment to stabilisation of substrate and conformation

by Lazzarin,E.,... 在 www.biorxiv.org 10-13-2023

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.10.10.561652v3

更深入的查询

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