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RNAiにおける標的遺伝子特異的な要求の違いは、複数の調節因子が関与する単一のネットワークによって説明できる。
Tiivistelmä
本研究では、RNAiにおける標的遺伝子特異的な要求の違いを明らかにした。
RNAiの主要な調節因子であるMUT-16、RDE-10、NRDE-3のうち、任意の2つが欠失すると、bli-1とunc-22の両方の遺伝子のサイレンシングが阻害される。一方、単独欠失では、bli-1のサイレンシングは阻害されるが、unc-22のサイレンシングは維持される。
このような標的遺伝子特異的な要求の違いは、調節因子が並列的に作用するのではなく、単一の調節ネットワークの中で定量的に寄与していることで説明できる。
NRDE-3の要求は、dsRNAの処理を促進することで回避できるが、MUT-16やRDE-10の要求は回避できない。これは、NRDE-3の寄与が最も小さいことを示唆する。
数理モデルの解析から、標的遺伝子の転写調節領域の変化がRNAiの要求を変化させること、非分裂細胞でもRNAiから回復すること、pUG RNAの産生が制限されていることなどが明らかになった。
以上より、RNAiにおける標的遺伝子特異的な要求の違いは、調節因子が単一のネットワークの中で定量的に寄与することで説明できる。
Tilastot
RNAiにより、bli-1の発現は完全に抑制されるが、unc-22の発現は部分的に抑制される。
mut-16(-) rde-10(-) 二重変異体では、unc-22のサイレンシングが完全に阻害される。
eri-1の欠失により、NRDE-3の欠失によるbli-1のサイレンシング阻害は回避できるが、MUT-16やRDE-10の欠失によるbli-1のサイレンシング阻害は回避できない。
bli-1プロモーターを持つgfpの発現は、MUT-16やRDE-10の欠失によってサイレンシングが弱いが、NRDE-3の欠失では影響がない。
Lainaukset
"任意の2つが欠失すると、bli-1とunc-22の両方の遺伝子のサイレンシングが阻害される。"
"NRDE-3の要求は、dsRNAの処理を促進することで回避できるが、MUT-16やRDE-10の要求は回避できない。"
"標的遺伝子の転写調節領域の変化がRNAiの要求を変化させる。"