Concepts de base
단일 절단-결합 모델에서 쌍대 재배열 문제는 구성 요소 수에 대해 고정 매개변수 처리 가능하다.
Résumé
이 논문에서는 유전체 재배열 문제 중 하나인 쌍대 재배열 문제를 다룬다. 쌍대 재배열 문제는 두 개의 유전체를 입력으로 받아 최소 길이의 변환 시나리오 수를 계산하는 문제이다.
저자들은 단일 절단-결합 모델에서 쌍대 재배열 문제가 #P-완전이라는 기존 결과를 바탕으로, 매개변수 복잡성 관점에서 이 문제를 분석한다. 주요 결과는 다음과 같다:
- 인접 그래프에서 비트리비얼 구성 요소 수에 대해 쌍대 재배열 문제가 고정 매개변수 처리 가능하다.
- 두 유전체 간 거리에 대해서도 쌍대 재배열 문제가 고정 매개변수 처리 가능하다.
이러한 결과는 유전체 재배열 모델에서 효율적인 샘플링을 위한 핵심 장애물이 인접 그래프의 비트리비얼 구성 요소 수라는 점을 시사한다.
Stats
유전체 재배열 모델에서 두 유전체 간 거리는 다음과 같이 계산된다:
d(G1, G2) = n - #N/2 - #T + #C
여기서 n은 G1의 에지 수, #N은 N-shaped 구성 요소 수, #T는 트리비얼 크라운 수, #C는 비트리비얼 크라운 수이다.
Citations
"유전체 재배열 모델에서 두 유전체 간 거리는 다음과 같이 계산된다: d(G1, G2) = n - #N/2 - #T + #C"
"인접 그래프에서 비트리비얼 구성 요소 수가 유한하다면, 쌍대 재배열 문제가 고정 매개변수 처리 가능하다."