이 연구에서는 TAD 구조 분석과 실험적 조작을 통해 TAD 경계 결정 메커니즘에 대한 두 가지 모델, 즉 루프 압출 모델과 경계:경계 결합 모델을 평가하였다.
MicroC 분석 결과, eve 유전자 주변 TAD 구조는 루프 압출 모델의 예측과 일치하지 않았다. eve TAD는 stem-loop 구조를 보였지만, 루프 압출 중간체에서 예상되는 특징적인 교차결합 패턴이 관찰되지 않았다.
실험적 조작을 통해 eve 경계 요소 homie의 방향성을 변화시킨 결과, 보고자 유전자의 발현 패턴이 경계:경계 결합 모델의 예측과 일치하였다. 이는 fly TAD 경계가 기능적으로 자율적이지 않으며, 이웃 경계 요소와의 물리적 결합을 통해 TAD 구조가 결정된다는 것을 시사한다.
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by Bing,X., Ke,... à www.biorxiv.org 11-17-2023
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