מושגי ליבה
RNA二次構造におけるエンドヘアードパターンの分布は、マッチングにおけるそれとは大きく異なる。
תקציר
本研究では、マッチングにおけるエンドヘアードパターンの分布を理論的に分析し、実際のRNA二次構造データにおけるパターンの出現頻度を観察した。
マッチングでは、サイズ2のパターン
と
は同じ分布を持つことが示された。サイズ3のパターンは2つの等分布クラスに分かれる:
,
と
,
,
,
。これらのパターンの分布の漸近挙動も明らかにした。
一方、実際のRNA二次構造データでは、これらのパターンの出現頻度が理論的な予測とは大きく異なることが分かった。特に、擬結合を表す
パターンが非常に稀に観察されるのは興味深い。
この違いは、マッチングが制限のない単純なモデルであるのに対し、実際のRNA二次構造にはより複雑な特徴があることを示唆している。新しいモデルを開発し、RNA二次構造の本質的な特徴をパターンベースの制限で記述することが今後の課題である。
סטטיסטיקה
RNA二次構造中の
パターンの出現数は874。
パターンは4M4Oと5U3Gの2構造にのみ出現する。
RNA形状中の
パターンの出現数は55。
パターンは8構造に、
パターンは13構造に出現する。
ציטוטים
"RNA二次構造におけるエンドヘアードパターンの分布は、マッチングにおけるそれとは大きく異なる。"
"特に、擬結合を表す
パターンが非常に稀に観察されるのは興味深い。"