유전자 및 단백질을 위한 작지만 강력한 생물학적 서열 모델, BSM: 혼합 모달 데이터 학습을 통한 성능 향상
혼합 모달 데이터를 활용한 학습을 통해 유전자와 단백질 간의 관계를 효과적으로 학습하고, 이를 통해 작은 모델 크기로도 기존 대규모 모델에 필적하는 성능을 달성할 수 있다.
遺伝子とタンパク質のための小型ながら強力な生物学的シーケンスモデル、BSM
BSMは、DNA、RNA、タンパク質間の関係を学習することで、各モダリティの理解を深め、単一モーダルおよび混合モーダルタスクにおいて、より大規模なモデルに匹敵するパフォーマンスを実現する、小型ながら強力な生物学的シーケンス基盤モデルである。
植物間壓力傳遞的端到端數學建模與分析
本研究利用數學模型模擬植物如何透過釋放生物揮發性有機化合物 (BVOCs) 來傳遞壓力信號，並探討影響此傳遞過程的關鍵因素，以及植物如何利用比率偏移鍵控 (RSK) 來加密訊息和實現多用户通道。
システム生物学に基づく構造ベース創薬
本稿では、従来の構造ベース創薬にシステム生物学的視点を統合することで、標的特異性の高い低分子創薬を実現する新しい手法「システム構造ベース創薬（SSBDD）」を提案する。
빛 교란 하에서 모델 시아노박테리아의 탄소 대사 조절 시간 척도를 보여주는 전사체 및 산화환원 단백질체 분석
빛 교란에 대한 모델 시아노박테리아의 탄소 대사 적응 기작을 전사체 및 산화환원 단백질체 분석을 통해 규명하고, 빛 조절, 산화환원 반응, 일주기 리듬 간의 복잡한 상호 작용을 보여주는 일주기 리듬 교차점 모델을 제시합니다.
State-Space Universal Dynamic Equations for Recovering Complex Ecological Dynamics from Time Series Data: A Method for Inferring Nonlinear Dynamics and Forecasting Ecosystem Change
State-space universal dynamic equations (UDEs) effectively model and forecast complex ecological dynamics from time series data by combining the flexibility of neural networks with the interpretability of ecological theory.
利用數學模型探討過氧化還原蛋白與互斥轉錄因子活化的關聯
本研究利用數學模型模擬細胞內過氧化還原蛋白系統 (PTRS) 的動態變化，探討不同濃度的過氧化氫 (H2O2) 如何影響過氧化還原蛋白 (Prx) 的過氧化，並提出 PrxI 和 PrxII 的過氧化程度可能作為氧化壓力感測器，透過二硫鍵信號傳遞，依序激活不同轉錄因子 (如 FOXO1 和 p53)，進而調節細胞生長、損傷修復或細胞死亡等反應。
과산화레독신 단백질의 초과산화와 전사 인자 활성화의 상관관계: 수학적 모델을 이용한 고찰
인간 세포의 산화 스트레스 반응에서 2-Cys 과산화레독신-티오레독신 시스템(PTRS)이 산화 스트레스의 정도를 분류하고 그에 맞는 전사 반응을 활성화하는 데 중요한 역할을 한다는 것을 수학적 모델링과 시뮬레이션을 통해 입증하였다. 특히, Prx I 및 Prx II의 초과산화는 산화 스트레스 심각도를 감 sensing하는 스위치 역할을 하며, 이는 세포 성장, 손상 조절, 세포 사멸과 같은 다양한 세포 반응을 유도하는 전사 인자(p53, FOXO1 등)의 활성화와 연관되어 있음을 시사한다.
過酸化レドキシンプロテインと相互排他的な転写因子活性化の関係性を数学モデルを用いて検証する
本論文では、細胞の酸化ストレスに対する反応における過酸化レドキシンプロテイン（Prx）の役割を数学モデルを用いて検証し、Prxの過酸化が、p53とFOXO1といった転写因子の活性化を制御するスイッチとして機能するという仮説を支持する結果を得た。
이종 환경에서 질병 확산 및 개체군 지속성을 결정하는 새로운 관점: 네트워크 이질성 지수 소개
본 논문에서는 이종 환경에서 질병 확산 및 개체군 지속성에 영향을 미치는 요인을 분석하고, 이를 정량화하는 새로운 지표인 네트워크 이질성 지수(H)를 제시합니다.
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