本論文では、DNA配列の髪の毛状完成距離の計算問題について研究している。
髪の毛状完成は、DNA生化学で観察される髪の毛状形成に由来する文字列操作である。
右髪の毛状完成は、文字列Sを、Sの接頭辞の逆相補列Sに連結することで変換する。
左髪の毛状完成は、文字列Sを、Sの接尾辞の逆相補列Sに連結することで変換する。
髪の毛状完成距離は、文字列Sをに変換するのに必要な最小限の髪の毛状完成操作の数である。
先行研究では、この問題に対するO(n^2)時間アルゴリズムが提案されていた。
本論文では、強指数時間仮説が成り立つ限り、この問題に対するO(n^2-ε)時間アルゴリズムは存在しないことを示した。
つまり、強指数時間仮説の下では、この問題の時間計算量は二次時間、多項式因子以内が最適である。
Ke Bahasa Lain
dari konten sumber
arxiv.org
Wawasan Utama Disaring Dari
by Itai Boneh,D... pada arxiv.org 04-19-2024
https://arxiv.org/pdf/2404.11673.pdfPertanyaan yang Lebih Dalam