이 연구에서는 TAD 구조 분석과 실험적 조작을 통해 TAD 경계 결정 메커니즘에 대한 두 가지 모델, 즉 루프 압출 모델과 경계:경계 결합 모델을 평가하였다.
MicroC 분석 결과, eve 유전자 주변 TAD 구조는 루프 압출 모델의 예측과 일치하지 않았다. eve TAD는 stem-loop 구조를 보였지만, 루프 압출 중간체에서 예상되는 특징적인 교차결합 패턴이 관찰되지 않았다.
실험적 조작을 통해 eve 경계 요소 homie의 방향성을 변화시킨 결과, 보고자 유전자의 발현 패턴이 경계:경계 결합 모델의 예측과 일치하였다. 이는 fly TAD 경계가 기능적으로 자율적이지 않으며, 이웃 경계 요소와의 물리적 결합을 통해 TAD 구조가 결정된다는 것을 시사한다.
To Another Language
from source content
biorxiv.org
Key Insights Distilled From
by Bing,X., Ke,... at www.biorxiv.org 11-17-2023
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.11.17.567501v2Deeper Inquiries