Core Concepts
더 높은 코돈 적응도를 가진 척추동물 종은 더 높은 내재적 구조 무질서를 가진다.
Abstract
이 연구는 새로운 코돈 적응 지표인 CAIS(Codon Adaptation Index of Species)를 제안한다. CAIS는 기존의 코돈 적응 지표인 CAI와 ENC를 개선한 것으로, GC 함량과 아미노산 조성의 영향을 제거한다.
연구 결과, CAIS와 ENC 모두 척추동물 종의 단백질 내재적 구조 무질서(ISD)와 양의 상관관계를 보였다. 이는 더 높은 코돈 적응도를 가진 종일수록 단백질 구조가 더 무질서해짐을 의미한다. 이러한 경향은 오래된 단백질 도메인과 최근에 생긴 단백질 도메인 모두에서 관찰되었다.
CAIS는 GC 함량과 아미노산 조성의 영향을 제거하여 종 간 코돈 적응도를 더 정확하게 측정할 수 있다. 이를 통해 종의 적응도와 관련된 다양한 특성들을 발견할 수 있다. 본 연구에서는 단백질 내재적 구조 무질서가 그 예시로 제시되었다.
Stats
더 높은 CAIS 점수를 가진 척추동물 종일수록 단백질 도메인의 내재적 구조 무질서가 더 높다.
더 높은 ENC 점수를 가진 척추동물 종일수록 단백질 도메인의 내재적 구조 무질서가 더 높다.
Quotes
"더 높은 코돈 적응도를 가진 종일수록 단백질 구조가 더 무질서해짐을 의미한다."
"CAIS는 GC 함량과 아미노산 조성의 영향을 제거하여 종 간 코돈 적응도를 더 정확하게 측정할 수 있다."