Core Concepts
有向グラフの比較における最適輸送距離の重要性と効果を探求する。
Abstract
最適輸送によるグラフ比較の注目度が高まっている。
通常考慮される対称性の欠如が課題をもたらす。
本研究では、有向グラフ用の2つの距離尺度を提案し、シミュレートされたグラフデータと実世界の細胞間通信ネットワークで評価する。
ノード間距離メトリクスは、OTベースのグラフ距離計算に使用される。
シングルセルRNA-seqデータから推定された実世界の有向細胞間通信グラフをクラスタリングする際にOTベースの距離尺度が有用であることが示唆されている。
INTRODUCTION
最適輸送理論に基づく有向重み付きグラフ間の距離測定方法が提案されている。
グローバルエッジ反転は、局所エッジ反転よりも大きな距離を生じさせる可能性がある。
METHODS
有向重み付きグラフ間で2つの距離尺度を定義し、最適輸送理論に基づいて比較する方法が説明されている。
NUMERICAL EXPERIMENTS
合成グラフ上で行われた実験では、方向付けられたエッジを考慮した新しい手法が従来手法よりも優れていることが示されている。
実世界ケーススタディでは、病気クラスタリングにおいて提案手法が他手法よりも優れていることが示されている。
CONCLUSIONS
方向性エッジを考慮した新しいアプローチは、エッジ方向関連の重要な特徴を捉えられる。
細胞間通信ネットワーク比較における提案手法は病気段階やサブタイプを特定する能力を示している。
Stats
"GWHTD0.5" は "0.109974" の値を持つ。
"WassersteinGRD" は "0.884777" の値を持つ。
Quotes
"Comparing graphs by means of optimal transport has recently gained significant attention."
"Our results highlight the importance of considering edge directions when comparing graphs."