Core Concepts
NIH資金によるソフトウェアツールの集中知識ベース構築を目指す自動化手法。
Abstract
本内容は、臨床情報学分野におけるGitHubリポジトリの抽出と成熟度分析に焦点を当てた方法論を紹介しています。以下は内容の概要です:
自動化手法導入:
NIH資金で開発されたソフトウェアツールのGitHubリポジトリURLをarXivから抽出。
GitHub APIを使用して詳細なリポジトリ情報を取得し、星、フォーク、オープンイシュー、貢献者などのメトリクスで成熟度を分析。
方法:
検索戦略:arXiv APIを使用して関連する論文を検索。
URL抽出とクリーニング:正確なURL抽出と整形。
リポジトリ情報取得:GitHub APIで詳細な情報収集。
結果:
1000件の臨床情報学関連論文から33件のGitHubリポジトリ特定。
成熟度分析:星や貢献者数などで多様性があり、一部は高い成熟度を示す。
議論:
オープンソースソフトウェアへのアクセス向上と利用促進に有望な枠組み提供。
提案:
LLM(Large Language Models)の将来的統合により知識ベース強化。
Stats
NIH資金によって開発されたソフトウェアツールが重要。
GitHub APIを使用して詳細なレポジトリ情報収集。
Quotes
"この手法はNIH資金で開発されたソフトウェアツールの集中知識ベース構築に効果的"
"LLM(Large Language Models)統合は知識ベース強化へ"