本研究では、生化学的、構造的、計算モデリングアプローチを組み合わせて、mAMCase が酸性と中性の環境でどのように機能するかを調べた。
まず、広範な pH 範囲でのmAMCase活性を測定し、pH 2.0と pH 7.0に2つの最適活性ピークがあることを明らかにした。次に、mAMCase触媒ドメインとオリゴマーGlcNAcnの複合体の高分解能結晶構造を解いた。これにより、基質結合部位の複雑な配座異性が観察された。
さらに、分子動力学シミュレーションを行い、触媒残基Glu140が pH に応じて異なる機構で質子化されることを示唆した。
これらのデータから、mAMCaseは酸性条件と中性条件で異なる2つのメカニズムを使って基質を認識し、分解していることが明らかになった。この知見は、pH 調整可能な酵素バリアントの開発など、治療目的のためのAMCase改変に新しい機会を提供する。
To Another Language
from source content
biorxiv.org
Key Insights Distilled From
by Diaz,R. E., ... at www.biorxiv.org 06-03-2023
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.06.03.542675v3Deeper Inquiries