Core Concepts
일본 흰줄 문갑 조개의 고품질 염색체 수준 유전체 조립을 통해 연체동물 진화와 조간대 환경 적응에 대한 이해를 높일 수 있다.
Abstract
이 연구에서는 일본 흰줄 문갑 조개(Liolophura japonica)의 고품질 염색체 수준 유전체를 조립하였다. 총 8.77 Gb의 HiFi 염기서열과 약 397 Gb의 Omni-C 데이터를 이용하여 609.5 Mb 크기의 유전체를 조립하였다. 이는 96.1%의 BUSCO 완성도를 가지며, 13개의 의사염색체로 구성되어 있다. 총 28,233개의 유전자가 예측되었으며, 이 중 28,010개가 단백질 코딩 유전자이다. 반복서열 함량은 27.89%로 다른 문갑 조개 종과 유사하다. 이번 연구에서 제공된 유전체 자원은 문갑 조개의 진화 및 조간대 환경 적응에 대한 이해를 높이는 데 도움이 될 것이다.
Stats
조립된 유전체 크기: 609.5 Mb
염색체 수준 유전체 조립: 13개 의사염색체
단백질 코딩 유전자 수: 28,010개
반복서열 함량: 27.89%
Quotes
"이번 연구에서 제공된 고품질 염색체 수준 L. japonica 유전체는 이 종의 조간대 환경 적응에 대한 추가 통찰을 제공하고 문갑 조개와 다른 연체동물의 진화 생물학에 대한 향후 연구에 유용한 자원이 될 것이다."