EB1のC末端EBHドメインはSxIPモチーフを介して結合するが、SxIP配列自体は低親和性であり、その後の配列が重要である。EB1はSxIPモチーフとの初期結合(「ドック」)に続いて、C末端の折り畳み(「ロック」)によって高親和性の結合を形成する。
タンパク質複合体の一般的な分割手法では、構造的に非常に類似したタンパク質相互作用が訓練データと試験データに分散してしまい、モデルの汎化性能の評価が適切に行えない可能性がある。