이 연구에서는 6개의 불멸화된 인간 세포주에서 추출한 폴리아데닐화된 RNA를 이용하여 수정되지 않은 전사체 데이터셋을 생성하였다. 이 데이터셋은 나노포어 직접 RNA 분석을 위한 기준 데이터로 활용될 수 있다. 각 세포주의 데이터에서 GRCh38 참조 유전체와 일치하지 않는 위치를 식별하고 분류하였다. 이를 통해 RNA 수식화 분석 시 잠재적으로 혼란을 일으킬 수 있는 위치를 제외할 수 있다. 또한 이 데이터셋의 전사체 커버리지와 발현량을 생물학적 RNA 데이터와 비교하여 음성 대조군으로서의 적합성을 검증하였다. 이 데이터셋은 RNA 수식화 분석 커뮤니티에 유용한 자원이 될 것이며, 사용자가 추가적인 실험 없이도 분석을 수행할 수 있도록 전처리된 데이터를 제공한다.
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Kluczowe wnioski z
by McCormick,C.... o www.biorxiv.org 04-07-2023
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.04.06.535889v2Głębsze pytania