Neuroformer ist ein neuartiger Ansatz, um die Analyse großer, multimodaler Datensätze in den Neurowissenschaften zu ermöglichen. Das Modell wurde entwickelt, um die Komplexität von Datensätzen zu bewältigen, die aus parallelen Aufzeichnungen der Aktivität Hunderter oder Tausender von Neuronen sowie Verhaltens- und Stimulusdaten bestehen.
Neuroformer verwendet einen generativen, vortrainierten Transformeransatz, um die Vorhersage neuronaler Aktivität und die Modellierung der zugrunde liegenden neuronalen Schaltkreise zu ermöglichen. Das Modell skaliert linear mit der Größe der Eingabedaten und kann beliebig viele Modalitäten verarbeiten. Es wurde zunächst auf simulierten Datensätzen trainiert, wo es die simulierte neuronale Aktivität genau vorhersagen und die zugrunde liegende Konnektivität des neuronalen Schaltkreises, einschließlich der Richtung, intrinsisch ableiten konnte.
Bei der Anwendung auf reale Datensätze zeigte Neuroformer eine höhere Leistung bei der Vorhersage neuronaler Aktivität im Vergleich zu herkömmlichen Methoden wie dem Generalisierten Linearen Modell (GLM). Darüber hinaus lieferte die Analyse der Aufmerksamkeitsmechanismen des Modells datengesteuerte Karten der Stimulusmerkmale, die mit den neuronalen Antworten in Beziehung stehen.
Schließlich konnte Neuroformer das Verhalten eines Mausmodells mit nur wenigen Feinabstimmungsschritten vorhersagen, was darauf hindeutet, dass das Modell direkt aus den neuronalen Repräsentationen selbst lernt, wie es Verhalten vorhersagt, ohne explizite Überwachung. Diese Ergebnisse zeigen, dass Neuroformer neurowissenschaftliche Datensätze und ihre emergenten Eigenschaften analysieren kann und so die Entwicklung von Modellen und Hypothesen über das Gehirn unterstützt.
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