本研究では、TetRアロステリーを記述するための二つのドメインの統計熱力学モデルを開発した。このモデルは、リガンド結合ドメイン(LBD)と DNA結合ドメイン(DBD)の二つのドメインから成り、それぞれが活性と不活性の二つの状態を持つ。二つのドメインは負の協調性を持ち、これがTetRのアロステリー調節の基盤となる。
このモデルは、以下の点を説明できる:
モデルの定量的な解析により、変異がLBDとDBDの内部特性(ɛD、ɛL)や二つのドメイン間の相互作用(γ)にどのように影響するかが明らかになった。これにより、変異の多様な影響がアロステリー調節の物理的基盤から理解できる。
また、モデルを用いて実験的に得られた変異体のインダクション曲線を精度良く再現できることを示した。これにより、変異の影響を定量的に評価し、変異間の相互作用(エピスタシス)を解析することができる。
本研究の知見は、TetRファミリーを超えて、他の二つのドメインを持つアロステリー蛋白質一般に適用可能と期待される。
To Another Language
from source content
biorxiv.org
Thông tin chi tiết chính được chắt lọc từ
by Liu,Z., Gill... lúc www.biorxiv.org 08-06-2023
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.08.06.552196v3Yêu cầu sâu hơn