グラフ変換器は、従来のグラフニューラルネットワークの課題を克服し、優れた性能を示している。構造的および位置的エンコーディングを活用することで、グラフ構造を効果的にモデル化できる。また、グラフ変換器は過剰平滑化や過剰圧縮の問題を軽減できる可能性がある。