인과 기계 학습 모델은 정책 평가에 유연하게 적용될 수 있지만, 모델의 작동 원리를 이해하기 어려운 블랙박스 문제가 있다. 이는 정책 결정 과정의 공정성, 증거 해석의 정확성, 책임성 확보에 어려움을 초래한다.